23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0216 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  774    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  47.99 
 
 		 389 aa  296  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  43.6 
 
 		 419 aa  279  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  35.63 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  27.67 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  31.82 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  36.02 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  31.67 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  32.55 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  32.88 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  30.81 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  27.96 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  32.58 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  34.81 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  31.46 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  33.74 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  27.1 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  32.84 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4387  putative integral membrane protein  32.34 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.17799  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  26.09 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  27.65 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  34.4 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0574  hypothetical protein  23.18 
 
 		 422 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0845454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>