97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1368 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 85 aa  173  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  60.24 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  47.76 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  45.12 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  38.96 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  41.94 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  40.58 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  40.62 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  37.7 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  37.5 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  30.65 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  38.46 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  36.17 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  32.79 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  38.46 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0716  heavy metal transport/detoxification protein  30.77 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.162111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  34.43 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0611  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0501148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  33.87 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  32.31 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  30.51 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  32.26 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  26.51 
 
 		 833 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  32.26 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  26.58 
 
 		 837 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  29.51 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 		 65 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  33.87 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  37.14 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 850 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  32.26 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  32.26 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  32.26 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  32.26 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 867 aa  40.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  26.51 
 
 		 811 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  29.51 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  39.29 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  26.51 
 
 		 811 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  29.31 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  41.54 
 
 		 67 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>