79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0938 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 160 aa  320  4e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  37.59 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  34.75 
 
 		 145 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  42.86 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  89  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  34.93 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  34.97 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  34.65 
 
 		 144 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  34.11 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  34.06 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  37.86 
 
 		 145 aa  84.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  33.57 
 
 		 145 aa  84  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  33.57 
 
 		 145 aa  84  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  35.66 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  38.41 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  35.17 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  37.93 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  38.57 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  37.93 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  37.93 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  34.27 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  36.13 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  35.17 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  35.17 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  35.17 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  32.33 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  32.41 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  32.41 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  35.17 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  35.17 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  33.78 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  31.58 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  32.19 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  31.3 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  29.29 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  25.69 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  25.49 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  25.49 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  25.49 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  24.16 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  23.65 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0110  cyclase/dehydrase  32.59 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.37666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  28.08 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  27.78 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  26.36 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  31.69 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  27.7 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  31.69 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  26.36 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  26.36 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  27.4 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1519  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  29.29 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3374  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  29.93 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  22.06 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1462  cyclase/dehydrase  28.72 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.249218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  22.07 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  30.08 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  29.31 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  25.52 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3614  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  hitchhiker  0.000136105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  31.71 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  24.5 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>