63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6066 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 146 aa  293  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  49.31 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  48.61 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  45.83 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  44.44 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  44.9 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  46.85 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  46.15 
 
 		 145 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  44.83 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  45.14 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  42.47 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  41.78 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  39.58 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  43.06 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  43.06 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  42.47 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  39.58 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  36.62 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  42.36 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  34.93 
 
 		 160 aa  87.4  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  31.94 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  35.11 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  35.11 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  35.11 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  29.77 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  29.77 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  29.77 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  34.06 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  25.9 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  25.9 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  25.9 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  26.95 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2345  hypothetical protein  28.06 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0639664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2306  hypothetical protein  28.06 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2353  hypothetical protein  28.06 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  25.36 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  26.43 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  26.43 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  25.17 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  24.11 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  22.3 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  25.71 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3786  hypothetical protein  28.7 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.877035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  27.41 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12594  hypothetical protein  24.32 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.597644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2614  hypothetical protein  26.62 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 319 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  23.02 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.98 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>