57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5073 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  100 
 
 
156 aa  313  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  88.36 
 
 
146 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  78.77 
 
 
148 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  78.77 
 
 
148 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  78.77 
 
 
148 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  61.64 
 
 
147 aa  191  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  56.85 
 
 
146 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  56.85 
 
 
146 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  56.85 
 
 
146 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  48.23 
 
 
147 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  48.23 
 
 
147 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  48.23 
 
 
147 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 
148 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 
148 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 
148 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  48.63 
 
 
145 aa  147  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  46.48 
 
 
146 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  42.96 
 
 
146 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  42.66 
 
 
157 aa  128  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  40.71 
 
 
146 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  38.89 
 
 
148 aa  121  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  42.47 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  40.16 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 
145 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  38.73 
 
 
144 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  37.14 
 
 
144 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 
145 aa  104  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  34.97 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  35.92 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  36.62 
 
 
145 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  36.11 
 
 
149 aa  92  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  35.42 
 
 
144 aa  90.5  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  34.51 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  34.48 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  35.17 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  30.28 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  29.66 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  26.32 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  24.06 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  24.44 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  26.45 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  28.04 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  27.1 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  24.83 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>