20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3174 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  314  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2774  hypothetical protein  45.75 
 
 
156 aa  169  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2141  hypothetical protein  48.7 
 
 
156 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2469  hypothetical protein  46.75 
 
 
157 aa  167  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2068  hypothetical protein  48.7 
 
 
156 aa  165  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0314  hypothetical protein  46.1 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000595453 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0862  hypothetical protein  33.55 
 
 
158 aa  97.1  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.969301  normal  0.318231 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  23.57 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1738  cyclase/dehydrase  29.66 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.265595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  27.61 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  25 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  30.99 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  23.78 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 
147 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  24.83 
 
 
146 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  24.83 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  24.32 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>