49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10873 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  58.14 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  59.54 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  56.15 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  55.65 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  55.65 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  54.84 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  58.73 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  40.94 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  40.16 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  39.37 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  39.37 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  39.37 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  37.9 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  35.46 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  39.68 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  32.54 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  29.01 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  31.54 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  29.77 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  28.24 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  29.13 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  28.8 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  27.56 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  28.33 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  27.56 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  27.56 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  27.13 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  27.13 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  25.19 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  28.26 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  29.37 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  26.56 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  27.56 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  23.58 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  25.95 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  25.38 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  27.91 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  27.91 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  27.91 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 146 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>