51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5071 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  100 
 
 
148 aa  300  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  59.29 
 
 
157 aa  174  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  54.11 
 
 
146 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  54.68 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  54.68 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  53.96 
 
 
147 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  53.85 
 
 
146 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  58.73 
 
 
144 aa  157  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 
148 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 
148 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 
148 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  38.89 
 
 
156 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  40 
 
 
146 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  38.78 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  38.78 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  38.78 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  38.1 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 
148 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 
148 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  34.72 
 
 
147 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  32.61 
 
 
146 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  34.04 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  27.61 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  27.61 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  27.61 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  30.99 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  27.46 
 
 
145 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  28.87 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  31.08 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  30.61 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  28.38 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  26.95 
 
 
146 aa  53.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  30.2 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  30.14 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  29.58 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  26.03 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  22.39 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  24.48 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  29.93 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>