56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4883 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  100 
 
 
148 aa  297  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  100 
 
 
148 aa  297  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  100 
 
 
148 aa  297  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  78.77 
 
 
156 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  76.71 
 
 
146 aa  237  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  64.38 
 
 
147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  58.5 
 
 
146 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  58.5 
 
 
146 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  58.5 
 
 
146 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  48.25 
 
 
145 aa  150  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  48.94 
 
 
147 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  48.94 
 
 
147 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  48.94 
 
 
147 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 
148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 
148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  47.89 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  43.75 
 
 
146 aa  130  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  45.07 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  42.96 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 
148 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  37.78 
 
 
144 aa  110  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  38.81 
 
 
144 aa  103  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  38.57 
 
 
144 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 
145 aa  100  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  35.92 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  37.93 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 
146 aa  92  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  36.81 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  36.36 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  36.62 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  33.1 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 
145 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  29.63 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  29.77 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  32.64 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  29.8 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  23.94 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  23.94 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  23.94 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  25 
 
 
161 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  23.31 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  22.14 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  26.13 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1697  cyclase/dehydrase  23.31 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.128204  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  39.47 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>