More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0403 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0403  ribosomal protein L22  100 
 
 		 218 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  49.57 
 
 		 136 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  40.22 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  41.86 
 
 		 158 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  49.54 
 
 		 139 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 117 aa  99  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 117 aa  99  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  55.21 
 
 		 113 aa  98.6  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  54.84 
 
 		 136 aa  98.6  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 117 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  49.04 
 
 		 152 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  49.04 
 
 		 152 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  48.15 
 
 		 114 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  52.69 
 
 		 146 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  48.7 
 
 		 119 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  50.48 
 
 		 113 aa  96.3  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 		 109 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  53.26 
 
 		 120 aa  96.7  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  56.7 
 
 		 115 aa  96.7  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 125 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  46.49 
 
 		 120 aa  95.9  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  48.08 
 
 		 117 aa  95.5  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  50.48 
 
 		 110 aa  95.5  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  52.08 
 
 		 142 aa  95.5  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1045  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 		 177 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 113 aa  95.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  51.06 
 
 		 120 aa  95.1  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1018  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 		 177 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1035  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 		 177 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  54.84 
 
 		 125 aa  94.7  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  42.99 
 
 		 113 aa  94  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 113 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 113 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  50 
 
 		 133 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  47.22 
 
 		 140 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 113 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 113 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  48.67 
 
 		 126 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 113 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 113 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 113 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 113 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 113 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 113 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 113 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  49.52 
 
 		 109 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  49.52 
 
 		 109 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 		 113 aa  91.7  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 112 aa  91.7  8e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  47.42 
 
 		 113 aa  91.7  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  43.59 
 
 		 118 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  47.83 
 
 		 119 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  49.52 
 
 		 113 aa  91.3  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 111 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 		 113 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 		 114 aa  90.1  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 117 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0278  50S ribosomal protein L22  46.67 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000221051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 114 aa  90.1  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  46.79 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0283  50S ribosomal protein L22  46.67 
 
 		 110 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0463938  hitchhiker  0.0000000066238 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  52.58 
 
 		 116 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  48.98 
 
 		 110 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  48.98 
 
 		 110 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  48.04 
 
 		 110 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 113 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  44.79 
 
 		 128 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  50.48 
 
 		 113 aa  89.4  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 128 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0343  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.056681  decreased coverage  0.000263918 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 113 aa  88.6  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1310  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 		 155 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884294  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  49.53 
 
 		 112 aa  88.6  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0936  ribosomal protein L22  51.28 
 
 		 130 aa  88.2  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  49.53 
 
 		 110 aa  88.2  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 113 aa  88.2  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  48.94 
 
 		 118 aa  88.2  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4271  ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000256  unclonable  0.00000000000290702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  48.67 
 
 		 147 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>