67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0830 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
75 aa  147  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2142  excisionase/Xis, DNA-binding  60 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.276898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  46.55 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  49.09 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  53.49 
 
 
66 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  48.89 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  41.54 
 
 
315 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  45.45 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  45.45 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  45.45 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  45.45 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 
305 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  45.45 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  43.64 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  40 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.59 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  40 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  51.16 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  40 
 
 
315 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  40 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  40 
 
 
315 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  40 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  43.64 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  43.64 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  52.54 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  43.64 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  43.64 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  40.74 
 
 
306 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  42.59 
 
 
306 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  51.16 
 
 
78 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  54.55 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  48.84 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  46.81 
 
 
308 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  55.26 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  53.85 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  44.44 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  45.28 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  39.62 
 
 
326 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  48.84 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0880  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0183206  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  51.16 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  50 
 
 
317 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1359  hypothetical protein  43.86 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  44.07 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  42.31 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3033  excisionase/Xis, DNA-binding  51.02 
 
 
304 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.627333  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  51.28 
 
 
112 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  39.29 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  52.63 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4226  DNA binding domain-containing protein  45.1 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.89473  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  44.19 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1600  excisionase/Xis, DNA-binding protein  48.94 
 
 
71 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.607243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3435  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 
75 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310472  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  42.86 
 
 
320 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  43.1 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 
315 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0513  DNA binding domain-containing protein  34 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.252241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  51.16 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  36 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3678  excision promoter, Xis  45 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>