24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0880 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0880  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 81 aa  159  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0183206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1359  hypothetical protein  88.33 
 
 		 69 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2142  excisionase/Xis, DNA-binding  42.62 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.276898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2463  DNA binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000388448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  37.5 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  37.04 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  37.29 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  36.73 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  37.5 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  34.69 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  38.89 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  37.78 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  33.96 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>