292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1586 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1586  major facilitator transporter  100 
 
 
448 aa  861    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0030166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0170  major facilitator superfamily MFS_1  51.06 
 
 
452 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2556  major facilitator family transporter  49.41 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2259  nitrite extrusion protein, putative  49.41 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0505  major facilitator transporter  49.51 
 
 
437 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0881  major facilitator transporter  39.84 
 
 
417 aa  226  6e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1747  major facilitator transporter  45.27 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  28.96 
 
 
912 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  30.7 
 
 
905 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  27.15 
 
 
441 aa  124  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  29.01 
 
 
895 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  27.02 
 
 
389 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  27.02 
 
 
389 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  30.92 
 
 
460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  32.45 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  27.91 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  27.34 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  28.57 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  29.27 
 
 
917 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.75 
 
 
426 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  27.67 
 
 
389 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  27.67 
 
 
389 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  27.67 
 
 
389 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  27.75 
 
 
426 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  27.67 
 
 
389 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  29.43 
 
 
402 aa  118  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.72 
 
 
417 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  27.75 
 
 
435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  27.21 
 
 
418 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  27.25 
 
 
389 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  31.9 
 
 
398 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  27.25 
 
 
389 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  27.01 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  30.39 
 
 
406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  27.18 
 
 
426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  29.53 
 
 
431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
417 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
435 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  30.99 
 
 
417 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
397 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  28.95 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  27.07 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  30.81 
 
 
403 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  28.38 
 
 
426 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  30.19 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
382 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  28.5 
 
 
431 aa  113  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
419 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  26.96 
 
 
425 aa  113  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  31.3 
 
 
418 aa  113  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  29.66 
 
 
424 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  26.68 
 
 
428 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  30.84 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.75 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.75 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  28.2 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.75 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  29.5 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.75 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  28.75 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  31.08 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  27.75 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  28.16 
 
 
389 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  25.99 
 
 
424 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  29.35 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  30.05 
 
 
893 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  26.94 
 
 
440 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  28.76 
 
 
453 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
413 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  32.11 
 
 
411 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  29.04 
 
 
422 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  29.18 
 
 
406 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  28.4 
 
 
439 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  29.18 
 
 
406 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
398 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  29.18 
 
 
406 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  27.56 
 
 
420 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  26.5 
 
 
436 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  31.41 
 
 
403 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  28.75 
 
 
459 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  29.43 
 
 
424 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  29.69 
 
 
424 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  30.99 
 
 
399 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  27.46 
 
 
422 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
403 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
419 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  28.23 
 
 
390 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  30.42 
 
 
418 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  30 
 
 
403 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  29.43 
 
 
424 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  29.98 
 
 
472 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
443 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>