32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1408 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  227  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  44.86 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  43.59 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  47.44 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  49.18 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  38.36 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  43.42 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  38.95 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  35.05 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  42.65 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  39.47 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  38.89 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  35.85 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  40 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  41.46 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  35.06 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  38.27 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  38.27 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  33.96 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  36.07 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3081  hypothetical protein  52.63 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1153  hypothetical protein  33.71 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0014547  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  54.84 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  54.84 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  31.65 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2561  hypothetical protein  36.99 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  32.05 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  35.42 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2969  hypothetical protein  39.34 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0036  hypothetical protein  46 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>