52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0955 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0955  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.67 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  45.33 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 169 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  46.77 
 
 		 200 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  36.96 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  46.77 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.72 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.37 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  45.16 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.87 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  43.75 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  36.59 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  42.19 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.43 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.02 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.27 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.17 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0588  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.6 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  39.44 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  37.5 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  39.66 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.7 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  32.53 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  35.21 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  35.21 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  34.43 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.59 
 
 		 167 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.21 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  34.43 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  34.43 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  34.43 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.43 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  34.43 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  34.43 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  34.43 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  34.43 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  27.96 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  32.81 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  32.79 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1144  twin-arginine translocation protein TatB  40.82 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  26.96 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.43 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  28.57 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>