More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0401 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  71.18 
 
 
180 aa  250  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  68.42 
 
 
171 aa  243  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.75 
 
 
170 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
172 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
172 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 
174 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  52.53 
 
 
424 aa  168  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  167  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
172 aa  167  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 
176 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  50.9 
 
 
184 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
175 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
172 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
172 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
175 aa  164  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  53.16 
 
 
173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
179 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
171 aa  161  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
170 aa  161  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
173 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  50.62 
 
 
171 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
182 aa  160  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
170 aa  160  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
184 aa  160  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
181 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
175 aa  160  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
170 aa  159  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
172 aa  158  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 
168 aa  158  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
170 aa  158  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
181 aa  158  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
182 aa  157  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  52.53 
 
 
178 aa  157  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
172 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 
172 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
199 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
172 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
187 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
179 aa  155  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
181 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
172 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
187 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
187 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
181 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
172 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
172 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
179 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
184 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
184 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
184 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
181 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
184 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
181 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
181 aa  154  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
170 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
181 aa  154  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
197 aa  154  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  48.43 
 
 
198 aa  154  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  46.71 
 
 
183 aa  153  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
183 aa  153  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
183 aa  153  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
183 aa  153  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
183 aa  153  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
183 aa  153  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
183 aa  153  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
183 aa  153  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
184 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
171 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
170 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
181 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
172 aa  152  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
184 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
181 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
185 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
181 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
180 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
172 aa  151  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
171 aa  151  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
181 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
181 aa  151  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
182 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
172 aa  150  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
181 aa  150  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
181 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
182 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
171 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0821  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
175 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
185 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
183 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>