24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2775 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  100 
 
 
1182 aa  2306    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  52.3 
 
 
1189 aa  270  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  51.29 
 
 
1117 aa  249  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  51.27 
 
 
673 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  50.55 
 
 
847 aa  245  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  47.08 
 
 
968 aa  231  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  48.34 
 
 
974 aa  231  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  51.08 
 
 
1083 aa  230  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  48.94 
 
 
709 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  44.89 
 
 
924 aa  207  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  45.62 
 
 
1126 aa  195  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  46.99 
 
 
833 aa  148  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0386  hypothetical protein  70.97 
 
 
164 aa  94.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  29.61 
 
 
574 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  33.53 
 
 
845 aa  58.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  25.86 
 
 
744 aa  55.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  59.09 
 
 
1695 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  43.01 
 
 
1241 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  44.14 
 
 
631 aa  50.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  43.48 
 
 
487 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  26.15 
 
 
807 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4871  hypothetical protein  33.33 
 
 
1045 aa  46.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  34.19 
 
 
1227 aa  46.2  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  32.83 
 
 
1118 aa  45.8  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>