More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0562 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  100 
 
 
131 aa  261  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
130 aa  154  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  54.62 
 
 
133 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 
130 aa  147  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 
130 aa  146  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 
130 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
130 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  54.96 
 
 
131 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  54.96 
 
 
131 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  143  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  142  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  142  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  51.97 
 
 
129 aa  141  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
130 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  141  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 
132 aa  140  6e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  51.18 
 
 
129 aa  139  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  52.99 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  51.61 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  53.33 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  52.99 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  137  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
128 aa  136  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 
130 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 
158 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  54.2 
 
 
129 aa  136  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  52.85 
 
 
170 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  51.91 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  53.54 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
165 aa  134  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  53.6 
 
 
130 aa  134  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 
160 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 
159 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  51.91 
 
 
130 aa  133  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 
130 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 
130 aa  133  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 
130 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 
130 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 
130 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 
130 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
136 aa  133  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  49.21 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  52.27 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  50.81 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  54.03 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44376  Putative mitochondrial ribosomal protein S9  50 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272268  normal  0.0615746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  51.91 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  53.23 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  48.41 
 
 
130 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  48.41 
 
 
130 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
128 aa  131  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  48.41 
 
 
130 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  48.41 
 
 
130 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
164 aa  131  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  48.41 
 
 
130 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  48.41 
 
 
130 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>