29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1471 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  52.63 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  45.63 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  39.47 
 
 		 166 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1507  peptidoglycan-binding LysM  37.37 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0341474  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  35.77 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1478  peptidoglycan-binding LysM  40.2 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00563925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.04 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2432  Peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3978  Peptidoglycan-binding LysM  46.3 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  29.47 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2718  Peptidoglycan-binding LysM  26.32 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.12772e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3901  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.79 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1259  Peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.149605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  33.66 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0573  LysM domain protein  26.83 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0448412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  34.34 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10630  LysM domain-containing protein  31 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23030  LysM domain-containing protein  38.83 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0772  peptidoglycan-binding LysM  39.13 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000768092  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1809  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.29 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0414722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  39.71 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3509  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2119  cell division suppressor protein YneA  28.12 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  36.92 
 
 		 522 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0857  peptidoglycan-binding LysM  38.71 
 
 		 93 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.555346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>