215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0440 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0440  Glycerate kinase  100 
 
 
389 aa  751    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  43.75 
 
 
377 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08140  glycerate kinase  47.3 
 
 
401 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0243  glycerate kinase  45.17 
 
 
377 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  44.29 
 
 
375 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  41.98 
 
 
397 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  40.36 
 
 
398 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  40.06 
 
 
377 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  40.21 
 
 
409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  39.72 
 
 
378 aa  195  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  45.76 
 
 
381 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  42.63 
 
 
385 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1595  glycerate kinase  41.1 
 
 
376 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  39.44 
 
 
378 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  39.44 
 
 
378 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20350  glycerate kinase  44.87 
 
 
383 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  42.5 
 
 
380 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4727  glycerate kinase  46.82 
 
 
511 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740395  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  44.34 
 
 
381 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  41.32 
 
 
378 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  41.39 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  35.74 
 
 
380 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  37.57 
 
 
371 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  37.76 
 
 
381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  36.83 
 
 
408 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  36.83 
 
 
408 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  39.22 
 
 
378 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  36.83 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  39.09 
 
 
379 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  39.09 
 
 
379 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  36.83 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  39.09 
 
 
379 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  36.83 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  40.81 
 
 
382 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  39.09 
 
 
379 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  39.42 
 
 
381 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  33.81 
 
 
380 aa  179  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  33.81 
 
 
380 aa  179  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  36.53 
 
 
381 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  41.59 
 
 
395 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  41.34 
 
 
379 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  36.97 
 
 
381 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  38.51 
 
 
384 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  41.74 
 
 
383 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  42.82 
 
 
385 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  36.53 
 
 
381 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  37.13 
 
 
381 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  39.15 
 
 
381 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  39.15 
 
 
381 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  39.15 
 
 
381 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  43.85 
 
 
388 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  39.34 
 
 
379 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  43.85 
 
 
388 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  39.15 
 
 
381 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  39.15 
 
 
381 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  43.85 
 
 
388 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  39.15 
 
 
381 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  35.17 
 
 
374 aa  176  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  43.53 
 
 
394 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1476  glycerate kinase  45.95 
 
 
377 aa  176  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  38.92 
 
 
377 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2777  Glycerate kinase  38.12 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  37.88 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  38.36 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  38.23 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  40.06 
 
 
382 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  36.46 
 
 
380 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  38.48 
 
 
380 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  35.69 
 
 
378 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  40.06 
 
 
382 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  42.07 
 
 
380 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  38.48 
 
 
380 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  40.67 
 
 
379 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  37.92 
 
 
381 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  36.06 
 
 
384 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  37.92 
 
 
385 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  37.92 
 
 
385 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  38.18 
 
 
380 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0682  glycerate kinase, putative  34.76 
 
 
371 aa  171  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  39.81 
 
 
379 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0775  glycerate kinase  39.41 
 
 
389 aa  170  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  39.94 
 
 
381 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  38.29 
 
 
384 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  38.18 
 
 
380 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  40.06 
 
 
382 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  40.06 
 
 
382 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  38.53 
 
 
381 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  38.18 
 
 
381 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  38.18 
 
 
380 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  41.99 
 
 
389 aa  169  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  38.32 
 
 
381 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  37.76 
 
 
378 aa  169  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  34.85 
 
 
383 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  35.71 
 
 
373 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  38.23 
 
 
381 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  37.46 
 
 
380 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  39.76 
 
 
379 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  35.45 
 
 
373 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  40.48 
 
 
381 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  39.58 
 
 
388 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>