More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1446 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1446  cysteine--tRNA ligase  100 
 
 		 373 aa  743    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0549  Cysteine--tRNA ligase  61.25 
 
 		 372 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2573  Cysteine--tRNA ligase  59.67 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00340458  hitchhiker  0.000587086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22970  cysteinyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299926  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1016  cysteine--tRNA ligase  55.92 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0427365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0653  cysteine--tRNA ligase  55.41 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2219  Cysteine--tRNA ligase  57.99 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0471843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1206  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 392 aa  275  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1230  Cysteine--tRNA ligase  45.8 
 
 		 372 aa  275  9e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3331  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.552746  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4315  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 401 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2860  cysteinyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 400 aa  268  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000103148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4263  cysteinyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 459 aa  260  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 457 aa  250  3e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 456 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 481 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 455 aa  246  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 494 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 447 aa  245  8e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 460 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 465 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 485 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 487 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 485 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3478  cysteinyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 481 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1932  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  40.62 
 
 		 403 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 488 aa  237  2e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 460 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 480 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3049  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0153969  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 493 aa  235  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 459 aa  235  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4892  cysteinyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 444 aa  235  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00699487  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 460 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0825  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  37.02 
 
 		 497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1108  cysteinyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 473 aa  233  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.917766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 459 aa  232  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 459 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3165  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 415 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3153  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 415 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0176981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 466 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2140  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  42.15 
 
 		 414 aa  232  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3215  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 415 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2642  cysteinyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.736924  normal  0.302095 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 466 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5930  Cysteine--tRNA ligase  39.5 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0061  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.63624  normal  0.0841758 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 461 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 454 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 461 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 461 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 461 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 472 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 461 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 461 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1172  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 403 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  36.93 
 
 		 461 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12161  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 414 aa  229  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 460 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 460 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  38.89 
 
 		 485 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 468 aa  227  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 461 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>