More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4320 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  100 
 
 		 359 aa  719    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  61.92 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  42.33 
 
 		 423 aa  212  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3224  histidine kinase  33.51 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 437 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3132  histidine kinase  33.15 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.752444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.3 
 
 		 455 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2773  histidine kinase  34.7 
 
 		 374 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.1 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  33.22 
 
 		 482 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3085  sensor histidine kinase  32.51 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.389389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 408 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04835  two-component system sensor protein  34.41 
 
 		 397 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  35.47 
 
 		 463 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.88 
 
 		 467 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.69 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2736  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 368 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 493 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.36 
 
 		 512 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.29 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.83 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.47 
 
 		 457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.97 
 
 		 461 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.97 
 
 		 461 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  35.59 
 
 		 496 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.36 
 
 		 467 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 483 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  35.79 
 
 		 467 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  35.79 
 
 		 467 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  34.45 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  35.79 
 
 		 467 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.79 
 
 		 467 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 451 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.79 
 
 		 467 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.42 
 
 		 467 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.42 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.42 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.79 
 
 		 467 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.79 
 
 		 467 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.42 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.42 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  32.32 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.42 
 
 		 467 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 352 aa  156  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  34.08 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  34.66 
 
 		 470 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  34.91 
 
 		 558 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2693  histidine kinase  30 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.751419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  36.18 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  37.63 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 483 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.66 
 
 		 473 aa  149  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 471 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  33.45 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  33.45 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 379 aa  149  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 379 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  35.97 
 
 		 593 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3051  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.43 
 
 		 463 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  33.33 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.46 
 
 		 1162 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  31 
 
 		 471 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 357 aa  145  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5050  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 361 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 361 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  34.69 
 
 		 472 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  30.26 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  30.46 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4369  histidine kinase  37 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5743  histidine kinase  35.41 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.022107  hitchhiker  0.000697261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>