More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3120 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  59.82 
 
 
539 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  61.15 
 
 
546 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  77.98 
 
 
554 aa  857    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  64.59 
 
 
577 aa  672    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  68.34 
 
 
559 aa  717    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  61.84 
 
 
545 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  70.43 
 
 
564 aa  781    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  70.92 
 
 
561 aa  808    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  68.51 
 
 
562 aa  775    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  60.44 
 
 
539 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  61.66 
 
 
545 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  76.59 
 
 
559 aa  791    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  76.27 
 
 
552 aa  848    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  100 
 
 
550 aa  1113    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  67.96 
 
 
565 aa  779    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  78.16 
 
 
554 aa  860    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  61.81 
 
 
609 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  61.55 
 
 
566 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  60.6 
 
 
572 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  61.55 
 
 
566 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  61.81 
 
 
609 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  61.55 
 
 
566 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  60.6 
 
 
572 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  59.79 
 
 
566 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  60.6 
 
 
572 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  61.55 
 
 
566 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  61.81 
 
 
566 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  61.68 
 
 
566 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  60.6 
 
 
568 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  58.73 
 
 
538 aa  622  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  61.39 
 
 
561 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  59.83 
 
 
576 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  59.48 
 
 
576 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  60.43 
 
 
562 aa  621  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  60.58 
 
 
542 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  59.09 
 
 
535 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  56.47 
 
 
538 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  59.96 
 
 
537 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  56.6 
 
 
539 aa  560  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  52.18 
 
 
540 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  53.49 
 
 
540 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  53.49 
 
 
540 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  52.28 
 
 
542 aa  557  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  52.09 
 
 
542 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  53.31 
 
 
540 aa  555  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  53.47 
 
 
556 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  56.1 
 
 
549 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  56.1 
 
 
549 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  52.65 
 
 
554 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  53.65 
 
 
543 aa  535  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  50.64 
 
 
545 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  54.01 
 
 
546 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  50.54 
 
 
545 aa  529  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  52.38 
 
 
540 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  49.57 
 
 
577 aa  525  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  52.26 
 
 
561 aa  525  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  53.2 
 
 
541 aa  522  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  52.06 
 
 
583 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  53.54 
 
 
583 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  52.81 
 
 
547 aa  514  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  49.46 
 
 
557 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  51.71 
 
 
587 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  48.63 
 
 
536 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  50.09 
 
 
544 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  50.72 
 
 
585 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  47.42 
 
 
552 aa  501  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  51.68 
 
 
564 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  47.72 
 
 
536 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  51.18 
 
 
545 aa  498  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  48.03 
 
 
587 aa  496  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  47.35 
 
 
567 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  49.82 
 
 
559 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  48.82 
 
 
576 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  47.17 
 
 
567 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  50.27 
 
 
545 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  49.64 
 
 
587 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  50.72 
 
 
585 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  46.19 
 
 
576 aa  489  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  47.93 
 
 
573 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  48.09 
 
 
554 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  46.37 
 
 
576 aa  490  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  48.73 
 
 
559 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  48.73 
 
 
550 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  49.09 
 
 
560 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  48.82 
 
 
559 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  46.26 
 
 
566 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  50.82 
 
 
558 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  48.55 
 
 
550 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  49.09 
 
 
559 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.66 
 
 
566 aa  479  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  50.27 
 
 
583 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.13 
 
 
566 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.48 
 
 
566 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  49.19 
 
 
569 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.84 
 
 
552 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  45.41 
 
 
560 aa  465  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  41.9 
 
 
573 aa  464  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.58 
 
 
550 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  47.37 
 
 
553 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  42.58 
 
 
561 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>