28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1214 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  37.19 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  35.54 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  35.54 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  36.22 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  39.02 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  26.47 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  28.21 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  28.21 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  29.7 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  27.27 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  28.93 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  29.91 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00890  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain protein  30.17 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  30.33 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  29.91 
 
 
139 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  29.91 
 
 
139 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  27.87 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  25.64 
 
 
132 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3222  hypothetical protein  27.12 
 
 
134 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333438  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3426  hypothetical protein  27.12 
 
 
134 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  25.4 
 
 
138 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  26.5 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  31.07 
 
 
136 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  26.89 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  23.14 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  34.72 
 
 
133 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>