28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2506 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  100 
 
 		 229 aa  480  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  100 
 
 		 229 aa  480  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  50.23 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  41.09 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  35.75 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  35.75 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  35.32 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  34.72 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  34.2 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  31.02 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  36.27 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  33 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  30.7 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  36.73 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  28.64 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  28.64 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  28.64 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  28.64 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  24.12 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  23.08 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  23.96 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  28.35 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3149  hypothetical protein  25.11 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5219  hypothetical protein  25.11 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5053  hypothetical protein  25.11 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.734373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6542  hypothetical protein  31 
 
 		 211 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>