54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1053 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1192    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  37.08 
 
 		 598 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.39 
 
 		 608 aa  334  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  36.94 
 
 		 597 aa  329  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  36.4 
 
 		 607 aa  326  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  37.99 
 
 		 597 aa  319  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  36.68 
 
 		 491 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  36.69 
 
 		 496 aa  266  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  34.29 
 
 		 632 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.46 
 
 		 803 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  33.48 
 
 		 604 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  31.98 
 
 		 600 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  29.91 
 
 		 817 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.3 
 
 		 612 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  30.45 
 
 		 566 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.52 
 
 		 378 aa  114  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  29.01 
 
 		 538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  27.22 
 
 		 518 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  29.86 
 
 		 496 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.86 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  28.01 
 
 		 487 aa  104  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  28.08 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.78 
 
 		 342 aa  102  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  29.96 
 
 		 551 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  30.11 
 
 		 484 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  29.63 
 
 		 541 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  29.28 
 
 		 600 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  29.28 
 
 		 590 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  30.04 
 
 		 528 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  28.57 
 
 		 507 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 495 aa  95.1  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  28.71 
 
 		 310 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  31.3 
 
 		 663 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  29.25 
 
 		 391 aa  91.3  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  27.65 
 
 		 486 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  25.26 
 
 		 588 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.47 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  25.24 
 
 		 544 aa  73.9  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.84 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.3 
 
 		 392 aa  63.5  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.35 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  30.65 
 
 		 633 aa  55.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  29.06 
 
 		 878 aa  53.9  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.7 
 
 		 880 aa  52  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0181  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.41 
 
 		 242 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  21.99 
 
 		 334 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.53 
 
 		 885 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.12 
 
 		 224 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1765  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.37 
 
 		 226 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  26.7 
 
 		 592 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.63 
 
 		 428 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  26.09 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  27.4 
 
 		 667 aa  43.9  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  28.8 
 
 		 634 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>