38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2264 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2175  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  98.37 
 
 		 673 aa  651    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2264  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 628 aa  1079    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2123  HEAT repeat-containing PBS lyase  62.34 
 
 		 635 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209503  normal  0.0989309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.26 
 
 		 1343 aa  91.3  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.23 
 
 		 1148 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  24.85 
 
 		 958 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1094 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.41 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  24.56 
 
 		 644 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  29.1 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.62 
 
 		 1181 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.55 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.55 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.26 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.84 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.66 
 
 		 313 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  28.19 
 
 		 959 aa  53.9  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1224 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.79 
 
 		 1139 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.13 
 
 		 320 aa  53.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  26.44 
 
 		 1328 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.79 
 
 		 1041 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.87 
 
 		 670 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.22 
 
 		 157 aa  48.9  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.82 
 
 		 1438 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  34.22 
 
 		 1194 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.8 
 
 		 221 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.99 
 
 		 232 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  27.23 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.07 
 
 		 642 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.46 
 
 		 192 aa  45.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  37.1 
 
 		 1133 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  31.71 
 
 		 250 aa  45.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  32.59 
 
 		 1216 aa  44.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.3 
 
 		 1412 aa  45.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  36.77 
 
 		 319 aa  44.3  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  31.58 
 
 		 319 aa  43.9  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.61 
 
 		 180 aa  43.9  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>