79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Met-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0495998  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0025  tRNA-Met  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132615  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0671  tRNA-Met  87.67 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0047  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675982  normal  0.0740493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0041  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0033  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0038  tRNA-Met  89.39 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.545151  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0024  tRNA-Met  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0001  tRNA-Met  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0014  tRNA-Met  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000605229  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0010  tRNA-Met  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0072  tRNA-Met  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.916606  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0035  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna30  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.319262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0065  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0014  tRNA-Met  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0720319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0066  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0398911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0022  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt33  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt33  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60610  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.820326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60620  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.787941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0046  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0041  tRNA-Met  87.88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.904043  normal  0.246653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0007  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.045305  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27710  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0043  tRNA-Met  87.88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0026  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0003  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.22263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0010  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000189735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0052  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000909923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5887  tRNA-Phe  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0014  tRNA-Met  87.88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65159  normal  0.954278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0076  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  hitchhiker  0.00000000192681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0039  tRNA-Met  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0028  tRNA-Met  87.88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0016  tRNA-Met  87.88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68030  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351538  hitchhiker  0.008643 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0014  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_R0060  tRNA-Ile  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0062  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.6212e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0068  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0006  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0241224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>