More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Lys-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.205376  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0005  tRNA-Lys  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0034  tRNA-Lys  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0552  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146239  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0028  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501499  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0028  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0090  tRNA-Lys  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.28119  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0599  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0824  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0733527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0407  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0829  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0056  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0036  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127196  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0093  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.8722200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0022  tRNA-Lys  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0045  tRNA-Lys  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0379079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0051  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0001  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000658326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0040  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238807  hitchhiker  0.0000185517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0053  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60630  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0021  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0011  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000344573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0011  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000213973  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0026  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt011  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0172063  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt06  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000258702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0039  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.163516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0036  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0286926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0029  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0023  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA22  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140945  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t005  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t080  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t082  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0103  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000466787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R8  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023394  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0101  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000191032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0084  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr02  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0012  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000230734  normal  0.0248915 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0050  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0052  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000085939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0012  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000866174  hitchhiker  0.00954127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0127  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000904299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0092  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000157949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0094  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00138001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0133  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000500666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0011  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0006  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181943  normal  0.0306111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>