More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0001 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  594  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  49.83 
 
 
315 aa  282  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  49.66 
 
 
289 aa  282  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  46.1 
 
 
288 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  46.1 
 
 
290 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  47.88 
 
 
280 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  45.05 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  45.91 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  47.47 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  43.45 
 
 
295 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  44.14 
 
 
304 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  46.3 
 
 
294 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  44.37 
 
 
286 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  44.66 
 
 
294 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  47.62 
 
 
289 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  44.94 
 
 
292 aa  225  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  43.61 
 
 
289 aa  225  8e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  45.91 
 
 
286 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  45.35 
 
 
296 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  44.36 
 
 
292 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  43.8 
 
 
292 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  43.46 
 
 
290 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  43.97 
 
 
292 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  43.97 
 
 
292 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  43.97 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  43.97 
 
 
292 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  43.97 
 
 
292 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  43.97 
 
 
292 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  43.97 
 
 
292 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  44.17 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  43.55 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  45.6 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  41.96 
 
 
293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  43.53 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  43.3 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.92 
 
 
290 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  42.5 
 
 
287 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  47.37 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.92 
 
 
290 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.92 
 
 
290 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  42.66 
 
 
294 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  46.27 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  42.21 
 
 
291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  42.47 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  43.3 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  42.75 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  42.47 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  41.61 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  42.21 
 
 
309 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  41.5 
 
 
303 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  41.32 
 
 
295 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  42.32 
 
 
303 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  40.91 
 
 
293 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  43.53 
 
 
300 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  41.11 
 
 
307 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3738  parB-like partition proteins  46 
 
 
305 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.412058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  42.86 
 
 
305 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  43.02 
 
 
290 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  42.86 
 
 
297 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  42.32 
 
 
303 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  42.86 
 
 
297 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  43.3 
 
 
305 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  41.96 
 
 
295 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  41.96 
 
 
295 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  41.96 
 
 
295 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  41.96 
 
 
295 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  41.96 
 
 
295 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  41.96 
 
 
295 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  41.96 
 
 
295 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  42.86 
 
 
295 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  45.9 
 
 
293 aa  205  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  42.91 
 
 
303 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  40 
 
 
290 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  39.07 
 
 
297 aa  202  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  42.69 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  40.81 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  39.61 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  43.35 
 
 
311 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  40.44 
 
 
310 aa  199  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  44.57 
 
 
311 aa  198  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  49.28 
 
 
362 aa  198  9e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  44.31 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  42.42 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  41.28 
 
 
302 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  43.17 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  41.32 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  44.44 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  40.21 
 
 
304 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  40.71 
 
 
313 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  37.5 
 
 
286 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  41.96 
 
 
297 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  41.8 
 
 
305 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  48.13 
 
 
315 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.42 
 
 
286 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  42.47 
 
 
284 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  42.46 
 
 
297 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  41.9 
 
 
284 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  42.41 
 
 
282 aa  192  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  41.49 
 
 
286 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>