More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1321 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  70.01 
 
 
716 aa  1060  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  72.53 
 
 
699 aa  1075  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  71 
 
 
714 aa  1056  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  71 
 
 
714 aa  1055  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.86 
 
 
714 aa  1054  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.71 
 
 
714 aa  1052  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  69.87 
 
 
762 aa  1058  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  71 
 
 
714 aa  1056  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  67.13 
 
 
715 aa  1018  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  70.01 
 
 
716 aa  1060  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  71.96 
 
 
699 aa  1069  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.14 
 
 
701 aa  1035  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.15 
 
 
716 aa  1063  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.01 
 
 
716 aa  1060  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  70.01 
 
 
716 aa  1060  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  85.02 
 
 
732 aa  1255  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 
726 aa  1504  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.15 
 
 
716 aa  1063  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  99.86 
 
 
726 aa  1502  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.01 
 
 
716 aa  1060  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  69.87 
 
 
716 aa  1056  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.46 
 
 
725 aa  1027  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  99.86 
 
 
726 aa  1502  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.64 
 
 
694 aa  360  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.16 
 
 
703 aa  357  4e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.07544e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.85 
 
 
690 aa  357  6e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.8 
 
 
690 aa  353  6e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.88 
 
 
691 aa  352  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.85 
 
 
692 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.20367e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.47 
 
 
690 aa  351  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  3.22681e-05 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  33.19 
 
 
691 aa  351  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.47 
 
 
691 aa  350  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.46 
 
 
690 aa  350  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.71 
 
 
690 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.71 
 
 
690 aa  350  7e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.71 
 
 
690 aa  350  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.71 
 
 
690 aa  350  8e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.32 
 
 
690 aa  349  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.66 
 
 
690 aa  349  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.42 
 
 
691 aa  348  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.38 
 
 
690 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.79 
 
 
708 aa  347  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.01 
 
 
707 aa  343  6e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  7.14427e-07 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.42 
 
 
721 aa  342  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.29 
 
 
692 aa  339  1e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  4.11022e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.95 
 
 
691 aa  337  6e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.82 
 
 
711 aa  333  5e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.65 
 
 
725 aa  333  8e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.3 
 
 
714 aa  327  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  34.04 
 
 
750 aa  323  7e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.39 
 
 
686 aa  321  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.56 
 
 
720 aa  321  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.73 
 
 
714 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.47 
 
 
714 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 
714 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.58 
 
 
712 aa  311  3e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.15 
 
 
700 aa  311  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.57 
 
 
714 aa  309  1e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.57 
 
 
714 aa  309  1e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  8.38668e-05 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.29 
 
 
716 aa  308  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.52 
 
 
714 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.29 
 
 
714 aa  305  1e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.77 
 
 
714 aa  305  2e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.89 
 
 
738 aa  305  3e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  31.77 
 
 
714 aa  305  3e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.93 
 
 
714 aa  301  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.55 
 
 
710 aa  299  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.15 
 
 
758 aa  290  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.15 
 
 
729 aa  289  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.44 
 
 
692 aa  284  4e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.84 
 
 
741 aa  279  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  29.41 
 
 
664 aa  260  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.14 
 
 
929 aa  223  1e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  26.64 
 
 
822 aa  214  5e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.21 
 
 
930 aa  214  6e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  29.43 
 
 
659 aa  207  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.51 
 
 
929 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.79 
 
 
934 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.76 
 
 
927 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.9 
 
 
934 aa  204  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.27 
 
 
934 aa  203  1e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  28.55 
 
 
729 aa  202  2e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  25.53 
 
 
667 aa  202  2e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  28.94 
 
 
633 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.37 
 
 
934 aa  201  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.37 
 
 
934 aa  200  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.37 
 
 
934 aa  200  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.94 
 
 
934 aa  200  8e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.53 
 
 
934 aa  200  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.53 
 
 
934 aa  200  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  27.35 
 
 
662 aa  200  1e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.73 
 
 
952 aa  198  2e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  28.76 
 
 
636 aa  199  2e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  28.76 
 
 
631 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  28.76 
 
 
636 aa  198  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.94 
 
 
934 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  6.49538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  28.76 
 
 
636 aa  198  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  28.76 
 
 
636 aa  198  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  28.76 
 
 
636 aa  198  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.76 
 
 
636 aa  198  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>