58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1869 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  90.05 
 
 
422 aa  795    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  83.65 
 
 
420 aa  733    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  874    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  65.94 
 
 
426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  58.92 
 
 
424 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  58.69 
 
 
424 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  28.88 
 
 
527 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  28.73 
 
 
528 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  27.78 
 
 
528 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  26.97 
 
 
527 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  32.29 
 
 
538 aa  127  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  27.51 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  29.29 
 
 
465 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  26.35 
 
 
402 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  26.42 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  26.17 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  35.66 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  32.85 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  26.7 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  32.45 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  31.89 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  37.5 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  31.39 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  35.77 
 
 
376 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  30.3 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  36.09 
 
 
386 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  30.14 
 
 
346 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  32.81 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  30.52 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  31.85 
 
 
412 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  30.33 
 
 
400 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  21.82 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  31.21 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  26.42 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  27.83 
 
 
406 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  28.07 
 
 
417 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  27.63 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  27.63 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  31.03 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  31.03 
 
 
377 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  31.03 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  31.03 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  31.03 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  31.03 
 
 
377 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  26.97 
 
 
382 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  30.16 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  24.92 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  28.47 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  32.23 
 
 
451 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  26.77 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  33.66 
 
 
409 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  27.44 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  30.56 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  28.99 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  30.88 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  32.31 
 
 
427 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0186  Triacylglycerol lipase  25.45 
 
 
481 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  30.88 
 
 
427 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>