More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0057 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0057  HU family DNA-binding protein  100 
 
 		 101 aa  197  5e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0107  histone-like DNA-binding protein  55.43 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0162  integration host factor, alpha subunit  55.43 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  42.39 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  42.86 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  41.3 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  42.39 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1805  integration host factor, alpha subunit  36.96 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  37.36 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  37.36 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  38.89 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  35.16 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  38.89 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  39.13 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  39.56 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  38.46 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2591  integration host factor, alpha subunit  38.04 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.3815  normal  0.0354419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  38.46 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  39.13 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  39.13 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  38.46 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  39.13 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  38.3 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  37.63 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  36.67 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  38.04 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  36.67 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1405  integration host factor, alpha subunit  41.76 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1631  integration host factor subunit alpha  38.89 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3057  histone-like DNA-binding protein  36.26 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  36.96 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  36.96 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1417  integration host factor, alpha subunit  41.11 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.097817  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2365  integration host factor subunit alpha  41.3 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  34.78 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  38.04 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  40.66 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4986  histone family protein DNA-binding protein  35.87 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2384  integration host factor, alpha subunit  35.56 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2168  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  36.26 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1937  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0682795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  37.76 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  36.56 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  39.18 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  40.66 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  38.46 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  33.68 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  35.11 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  38.89 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0778  integration host factor subunit alpha  40 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1982  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219997  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  39.56 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0771  integration host factor subunit alpha  40 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.801748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  33.66 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1147  integration host factor subunit alpha  38.89 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.205645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2518  integration host factor subunit alpha  40 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  34.44 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2799  integration host factor subunit alpha  35.56 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  37.36 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  35.87 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1287  integration host factor subunit alpha  38.89 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.921659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  36.96 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  38.46 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0846  integration host factor subunit alpha  36.96 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000670658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  34.78 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  37.76 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  35.87 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1661  integration host factor, alpha subunit  38.04 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  35.87 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  37.76 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  35.87 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1198  integration host factor subunit alpha  37.78 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0830  integration host factor subunit alpha  37.78 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120813  normal  0.0891496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  40.22 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1751  integration host factor, alpha subunit  39.13 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2994  integration host factor, alpha subunit  36.96 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  33.33 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2108  integration host factor subunit alpha  42.39 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283165  normal  0.12287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  36.96 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02112  integration host factor subunit alpha  36.96 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003703  integration host factor alpha subunit  36.96 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2150  integration host factor subunit alpha  34.78 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.872084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  36.96 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1957  integration host factor subunit alpha  34.78 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.126843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2047  integration host factor subunit alpha  34.78 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1894  integration host factor subunit alpha  34.78 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.585308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  36.96 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1919  integration host factor subunit alpha  35.87 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.445655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2853  integration host factor subunit alpha  41.3 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.769617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2006  integration host factor subunit alpha  35.87 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.608113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1931  integration host factor subunit alpha  35.87 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000683366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>