52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4576 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  100 
 
 		 533 aa  1080    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  44.17 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  44.1 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  36.76 
 
 		 557 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  35.48 
 
 		 564 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  35.53 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  34.95 
 
 		 544 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  34.61 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  34.92 
 
 		 557 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  34.92 
 
 		 557 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  34.83 
 
 		 555 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  35.1 
 
 		 555 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  36.7 
 
 		 558 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  34.08 
 
 		 626 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  34.86 
 
 		 555 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  33.91 
 
 		 555 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  33.78 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  33.78 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  33.78 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  33.78 
 
 		 669 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  33.78 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  33.78 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  33.59 
 
 		 554 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  30.26 
 
 		 554 aa  177  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  26.71 
 
 		 549 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  26.65 
 
 		 550 aa  92  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  26.1 
 
 		 563 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  26.1 
 
 		 563 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  25.2 
 
 		 551 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  26.18 
 
 		 568 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  25.04 
 
 		 579 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  26.2 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  25.34 
 
 		 551 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  26.2 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  24.86 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  24.29 
 
 		 574 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  21.69 
 
 		 588 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  28.32 
 
 		 662 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  27.33 
 
 		 662 aa  54.7  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  26.39 
 
 		 615 aa  54.3  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  24.86 
 
 		 610 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.46 
 
 		 601 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  25.63 
 
 		 619 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  27.07 
 
 		 269 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  27.51 
 
 		 777 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0207  hypothetical protein  37.66 
 
 		 578 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  26.84 
 
 		 776 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.84 
 
 		 777 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  26.84 
 
 		 776 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2850  hypothetical protein  36.47 
 
 		 579 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4009  putative ATP-dependent helicase  38.89 
 
 		 677 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1715  UvrD/REP helicase  29.04 
 
 		 462 aa  43.9  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000356586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>