More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3321 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  56.3 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  55.64 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  55.95 
 
 		 254 aa  250  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  39.76 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  44.44 
 
 		 425 aa  178  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  39.36 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  39.34 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  42.26 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  38.55 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  37.1 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  36.69 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  36.69 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  36.69 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  37.1 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  39.18 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  39.92 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  34.17 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  35.48 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  33.88 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  39.6 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.29 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  36.65 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  38.31 
 
 		 282 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  38.71 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  36.29 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 		 261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  37.14 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 		 396 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  39.68 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  38.43 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  42.15 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  37.6 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  40 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  38.82 
 
 		 258 aa  148  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  41.74 
 
 		 393 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  39.58 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  38.59 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  39.58 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  35.27 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  35.27 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  38.59 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  38.24 
 
 		 392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  37.85 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  36.93 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  38.27 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  34 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  35.8 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  37.24 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  39.47 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  36.67 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  36.97 
 
 		 377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  34.39 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  37.14 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  38.82 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  36.1 
 
 		 263 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  36.1 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  37.02 
 
 		 266 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  34.87 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  34.78 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  36.48 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  35.34 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  36.64 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  32.23 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  37.19 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  35.71 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  32.22 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  36.33 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  36.21 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  32.51 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  40.85 
 
 		 393 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  37.24 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  32.1 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  34.03 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  36.08 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  34.54 
 
 		 390 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  36.59 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  35.08 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  38.96 
 
 		 397 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1118  3-oxoadipate enol-lactonase  37.96 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  35.8 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>