More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1062 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  100 
 
 		 368 aa  727    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  33.7 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  35.11 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  30.77 
 
 		 371 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  33.43 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  29.39 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  33.05 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  24.33 
 
 		 604 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  24.33 
 
 		 604 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  33.33 
 
 		 681 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  31.82 
 
 		 637 aa  99.8  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  43.56 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  31.74 
 
 		 667 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  34.93 
 
 		 665 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  34.01 
 
 		 695 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  26.4 
 
 		 607 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  41.22 
 
 		 671 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  31.42 
 
 		 673 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  31.21 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  30.62 
 
 		 690 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  41.45 
 
 		 680 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  41.45 
 
 		 681 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  30.43 
 
 		 710 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  41.45 
 
 		 681 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  30.43 
 
 		 710 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  39.6 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  29.46 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  31.29 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  40.74 
 
 		 583 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.35 
 
 		 616 aa  89.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  40.79 
 
 		 711 aa  89.4  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  33.02 
 
 		 632 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  39.56 
 
 		 671 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  26.65 
 
 		 641 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  28.57 
 
 		 660 aa  87.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  38.85 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  40.25 
 
 		 720 aa  86.7  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  34.88 
 
 		 386 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  39.33 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  29.25 
 
 		 635 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  33.19 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  30.81 
 
 		 645 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10112  transmembrane acyltransferase  42.5 
 
 		 685 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  30.63 
 
 		 671 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  27.95 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.61 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  29.39 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  25.61 
 
 		 603 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  25.61 
 
 		 603 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  43.92 
 
 		 656 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  37.67 
 
 		 734 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  29.53 
 
 		 645 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  37.82 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  29 
 
 		 629 aa  84  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  28.12 
 
 		 690 aa  84  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  30 
 
 		 656 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  42.36 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  38.82 
 
 		 662 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  29.97 
 
 		 634 aa  82.8  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 647 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 629 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  30.09 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  31.97 
 
 		 675 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  31.83 
 
 		 638 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  37.76 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  36.61 
 
 		 671 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  34.97 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  26.44 
 
 		 660 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  30.25 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  31.23 
 
 		 658 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  37.33 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  38.1 
 
 		 977 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  32.44 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  31.1 
 
 		 675 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  26.09 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.68 
 
 		 682 aa  80.1  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  26.33 
 
 		 660 aa  79.7  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  31.17 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6141  acyltransferase 3  34.87 
 
 		 799 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  31.47 
 
 		 713 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  30.94 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  27.76 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  35.44 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  28.73 
 
 		 662 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  26.49 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  31.53 
 
 		 759 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  39.77 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  37.09 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  39.77 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  23.21 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  39.77 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  36.99 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  37.93 
 
 		 625 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  30.08 
 
 		 660 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  25 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  40 
 
 		 679 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  37.58 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  26.81 
 
 		 602 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  28.29 
 
 		 643 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  27.87 
 
 		 690 aa  76.6  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>