More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0985 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  57 
 
 		 633 aa  752    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  57 
 
 		 633 aa  752    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  56.82 
 
 		 631 aa  737    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  49.28 
 
 		 618 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  57.07 
 
 		 631 aa  748    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  48.95 
 
 		 618 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  57.17 
 
 		 633 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  57 
 
 		 633 aa  752    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  57.95 
 
 		 634 aa  748    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  49.28 
 
 		 618 aa  642    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  70.23 
 
 		 638 aa  900    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  48.95 
 
 		 618 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  49.28 
 
 		 618 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  49.28 
 
 		 618 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  56.66 
 
 		 631 aa  736    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  57 
 
 		 633 aa  752    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  57.47 
 
 		 634 aa  747    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  57 
 
 		 633 aa  752    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  49.68 
 
 		 627 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  48.8 
 
 		 618 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  57.17 
 
 		 633 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  56.68 
 
 		 636 aa  737    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  57 
 
 		 633 aa  752    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  71.01 
 
 		 641 aa  940    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  57.17 
 
 		 633 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  53.48 
 
 		 643 aa  696    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  57.17 
 
 		 633 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  52.37 
 
 		 637 aa  670    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  56.66 
 
 		 631 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  49.19 
 
 		 618 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  49.19 
 
 		 618 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  55.86 
 
 		 633 aa  748    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  57.35 
 
 		 634 aa  736    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  57 
 
 		 633 aa  752    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  49.28 
 
 		 618 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  62.54 
 
 		 632 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  70.85 
 
 		 638 aa  939    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  51.22 
 
 		 637 aa  675    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  49.84 
 
 		 610 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  54.16 
 
 		 628 aa  692    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  57 
 
 		 633 aa  753    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  57.17 
 
 		 633 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 625 aa  1281    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  57 
 
 		 633 aa  752    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  49.36 
 
 		 652 aa  633  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  49.03 
 
 		 618 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  50.32 
 
 		 618 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  48.46 
 
 		 641 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  49.19 
 
 		 618 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  49.44 
 
 		 621 aa  605  9.999999999999999e-173  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  47.21 
 
 		 610 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  48.45 
 
 		 623 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  48.45 
 
 		 623 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  48.45 
 
 		 623 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  48.28 
 
 		 623 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  48.45 
 
 		 623 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  44.82 
 
 		 633 aa  565  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  45.06 
 
 		 629 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  43.86 
 
 		 630 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  45.31 
 
 		 631 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  44.89 
 
 		 629 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  44.32 
 
 		 629 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  44.32 
 
 		 629 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.46 
 
 		 618 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  44.82 
 
 		 631 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  44.66 
 
 		 631 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  44.25 
 
 		 646 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  42.46 
 
 		 645 aa  519  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  43.85 
 
 		 646 aa  515  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  43.04 
 
 		 632 aa  515  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.22 
 
 		 640 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  42.46 
 
 		 629 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  42.21 
 
 		 629 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  42.83 
 
 		 611 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  41.6 
 
 		 636 aa  502  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  42.53 
 
 		 630 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  42.74 
 
 		 619 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  41.56 
 
 		 630 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  42.37 
 
 		 681 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  42.81 
 
 		 646 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  41.17 
 
 		 631 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  40.2 
 
 		 607 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  41.41 
 
 		 626 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  41.17 
 
 		 667 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  41.33 
 
 		 655 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  40.33 
 
 		 673 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  41.19 
 
 		 793 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  41.9 
 
 		 678 aa  477  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  42.91 
 
 		 617 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  43.25 
 
 		 617 aa  475  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  40.68 
 
 		 766 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  42.06 
 
 		 662 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  39.38 
 
 		 630 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  42.07 
 
 		 626 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  39.65 
 
 		 767 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  40.09 
 
 		 764 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  40.31 
 
 		 630 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  40.03 
 
 		 800 aa  465  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  39.78 
 
 		 771 aa  465  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  39.75 
 
 		 756 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>