196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03028 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  51.16 
 
 
601 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  69.49 
 
 
600 aa  903    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  89.7 
 
 
602 aa  1126    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1241    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  43.95 
 
 
593 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  42.57 
 
 
598 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  42.57 
 
 
598 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  42.57 
 
 
598 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  38.84 
 
 
582 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  40.73 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  40.73 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  40.69 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  40.83 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  40.73 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  40.73 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  40.73 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  40.2 
 
 
586 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  40.69 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  40.69 
 
 
586 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  40.69 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  40.73 
 
 
586 aa  467  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  40.73 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  40.73 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  40.73 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  39.34 
 
 
582 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  39.97 
 
 
590 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  39.04 
 
 
590 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  36.96 
 
 
580 aa  405  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  36.88 
 
 
595 aa  398  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  35.38 
 
 
596 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  34.27 
 
 
596 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  34.27 
 
 
596 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  34.88 
 
 
592 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  34.27 
 
 
596 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  35.12 
 
 
595 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  34.05 
 
 
595 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  34.05 
 
 
595 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  34.05 
 
 
595 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  34.88 
 
 
594 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  33.89 
 
 
595 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  32.68 
 
 
604 aa  346  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  33.44 
 
 
595 aa  343  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  33.06 
 
 
596 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  33.22 
 
 
594 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  35.36 
 
 
594 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  31.16 
 
 
609 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  29.12 
 
 
613 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  29.1 
 
 
622 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  28.43 
 
 
617 aa  243  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  28.43 
 
 
617 aa  243  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  29.38 
 
 
611 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  28.62 
 
 
600 aa  224  4e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  28.81 
 
 
615 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  26.03 
 
 
637 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  28.03 
 
 
607 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  27.41 
 
 
607 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  25.17 
 
 
637 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  26.05 
 
 
638 aa  208  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25.88 
 
 
647 aa  207  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  27.49 
 
 
625 aa  193  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  26.52 
 
 
586 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25.73 
 
 
638 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  25.73 
 
 
635 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  25.31 
 
 
509 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  29.41 
 
 
641 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  30.37 
 
 
508 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  30.08 
 
 
642 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  26.21 
 
 
624 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  28.89 
 
 
614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  23.67 
 
 
630 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  23.63 
 
 
621 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  21.78 
 
 
621 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  21.49 
 
 
621 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  31.43 
 
 
495 aa  65.1  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  31.43 
 
 
495 aa  65.1  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  22.62 
 
 
873 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0528  sulfatase  25.91 
 
 
487 aa  61.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  26.67 
 
 
489 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  25.42 
 
 
487 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  22.89 
 
 
500 aa  53.9  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  26.47 
 
 
612 aa  53.9  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4030  sulfatase  23.84 
 
 
765 aa  53.9  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868128  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4712  twin-arginine translocation pathway signal  29.05 
 
 
600 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  36.56 
 
 
1041 aa  53.5  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  25.14 
 
 
1009 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2061  sulfatase  24.6 
 
 
495 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1478  sulfatase  27.78 
 
 
558 aa  51.2  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  22.8 
 
 
784 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0483  arylsulfatase A like protein  30.21 
 
 
611 aa  50.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  26.06 
 
 
517 aa  50.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  23.93 
 
 
508 aa  50.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  25 
 
 
625 aa  50.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  22.22 
 
 
633 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  30.69 
 
 
496 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  21.94 
 
 
614 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  26.79 
 
 
480 aa  50.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  26.87 
 
 
500 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  27.27 
 
 
483 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  30.69 
 
 
512 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  24.22 
 
 
666 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>