89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1808 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  68.84 
 
 
596 aa  896    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  68.78 
 
 
595 aa  877    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  69.18 
 
 
596 aa  899    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  69.01 
 
 
596 aa  898    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  75.46 
 
 
595 aa  966    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  62.81 
 
 
596 aa  800    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  63.98 
 
 
604 aa  815    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  65.49 
 
 
594 aa  867    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  100 
 
 
594 aa  1238    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  61.41 
 
 
594 aa  754    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  68.79 
 
 
595 aa  879    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  67.23 
 
 
595 aa  865    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  67.45 
 
 
592 aa  872    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  68.17 
 
 
596 aa  886    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  68.78 
 
 
595 aa  879    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  68.78 
 
 
595 aa  879    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  34.88 
 
 
602 aa  361  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  35.18 
 
 
602 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  33.94 
 
 
600 aa  357  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  33.28 
 
 
601 aa  339  7e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  33 
 
 
595 aa  310  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  31.4 
 
 
586 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  31.24 
 
 
586 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  31.24 
 
 
586 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  31.24 
 
 
586 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  31.24 
 
 
586 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  31.19 
 
 
586 aa  300  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  31.19 
 
 
586 aa  299  9e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  31.02 
 
 
586 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  31.02 
 
 
586 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  31.02 
 
 
586 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  31.02 
 
 
586 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  31.02 
 
 
586 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  31.02 
 
 
586 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  31.02 
 
 
586 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  30.82 
 
 
598 aa  291  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  30.82 
 
 
598 aa  291  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  30.82 
 
 
598 aa  291  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  30.25 
 
 
586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  30.77 
 
 
593 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  31.51 
 
 
580 aa  271  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  29.52 
 
 
590 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  28.48 
 
 
590 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  27.97 
 
 
582 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  27.88 
 
 
582 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  30.47 
 
 
615 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  29.46 
 
 
613 aa  212  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  26.9 
 
 
617 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  26.9 
 
 
617 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  26.93 
 
 
622 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  25.37 
 
 
600 aa  195  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  26.34 
 
 
611 aa  186  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  26.94 
 
 
609 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  25.91 
 
 
607 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  25.71 
 
 
637 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  31.45 
 
 
509 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  24.6 
 
 
637 aa  177  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  23.92 
 
 
647 aa  173  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  25.45 
 
 
586 aa  173  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  24.31 
 
 
638 aa  173  9e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  27.2 
 
 
635 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  27.2 
 
 
638 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  26.06 
 
 
607 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  26.55 
 
 
625 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  29.05 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  27.98 
 
 
642 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  26.44 
 
 
641 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  26.08 
 
 
624 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  25.41 
 
 
614 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  24.55 
 
 
621 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  23.83 
 
 
621 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  23.83 
 
 
621 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  22.8 
 
 
630 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  26.78 
 
 
513 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  27.87 
 
 
516 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  27.87 
 
 
516 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  20.57 
 
 
642 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  25.79 
 
 
554 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  21.08 
 
 
642 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  20.31 
 
 
642 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  26.19 
 
 
512 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  20.15 
 
 
642 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  20.15 
 
 
642 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  24.6 
 
 
515 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  27.56 
 
 
517 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  27.36 
 
 
511 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  27.05 
 
 
516 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  27.36 
 
 
516 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  27.36 
 
 
511 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>