199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3257 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  64.77 
 
 
586 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  61.74 
 
 
586 aa  782    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  61.74 
 
 
586 aa  782    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  64.93 
 
 
586 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  61.74 
 
 
586 aa  782    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  64.48 
 
 
590 aa  798    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  66.95 
 
 
582 aa  832    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  64.93 
 
 
586 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  75.59 
 
 
598 aa  939    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  61.74 
 
 
586 aa  782    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  64.6 
 
 
586 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  61.74 
 
 
586 aa  778    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  67.28 
 
 
582 aa  833    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  75.59 
 
 
598 aa  939    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  61.74 
 
 
586 aa  782    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  64.93 
 
 
586 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  64.2 
 
 
586 aa  801    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  66.11 
 
 
590 aa  817    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  61.74 
 
 
586 aa  782    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  75.59 
 
 
598 aa  939    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  61.74 
 
 
586 aa  782    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  61.74 
 
 
586 aa  781    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  100 
 
 
593 aa  1221    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  44.28 
 
 
602 aa  541  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  42.21 
 
 
601 aa  531  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  43.14 
 
 
602 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  42.6 
 
 
600 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  40.03 
 
 
580 aa  467  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  34.28 
 
 
595 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  32.02 
 
 
596 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  32.02 
 
 
596 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  31.91 
 
 
596 aa  309  8e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  32.24 
 
 
604 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  31.86 
 
 
596 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  31.58 
 
 
592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  31.58 
 
 
595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  31.58 
 
 
595 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  31.41 
 
 
595 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  31.41 
 
 
595 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  30.86 
 
 
595 aa  298  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  30.82 
 
 
594 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  30.71 
 
 
594 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  30.02 
 
 
595 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  30 
 
 
596 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  29.77 
 
 
613 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  29.04 
 
 
609 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  28.12 
 
 
617 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  28.12 
 
 
617 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  30.88 
 
 
594 aa  253  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  27.13 
 
 
637 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  26.81 
 
 
637 aa  237  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  25.94 
 
 
622 aa  232  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  26.92 
 
 
607 aa  207  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  27.64 
 
 
607 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  26.81 
 
 
647 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  26.81 
 
 
638 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  27.98 
 
 
611 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  26.36 
 
 
615 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  26.28 
 
 
600 aa  190  7e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  25.67 
 
 
625 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  25.88 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  27.91 
 
 
624 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25.88 
 
 
638 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  30.03 
 
 
586 aa  163  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  28.61 
 
 
509 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  28.54 
 
 
642 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  28.26 
 
 
641 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  25.15 
 
 
508 aa  153  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  26.98 
 
 
614 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  22.37 
 
 
630 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  24.5 
 
 
621 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  23.93 
 
 
621 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  23.93 
 
 
621 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  35.25 
 
 
628 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  35.25 
 
 
628 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  35.25 
 
 
628 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  35.25 
 
 
628 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  35.25 
 
 
628 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  35.25 
 
 
628 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  35.25 
 
 
628 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  35.25 
 
 
628 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  33.61 
 
 
628 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  33.61 
 
 
628 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  29.25 
 
 
495 aa  60.1  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  29.25 
 
 
495 aa  60.1  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1139  sulfatase  35.59 
 
 
628 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  23.3 
 
 
672 aa  58.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  29.75 
 
 
517 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  29.75 
 
 
522 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  29.75 
 
 
522 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  29.75 
 
 
522 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  29.75 
 
 
522 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  29.75 
 
 
522 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  29.75 
 
 
517 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0528  sulfatase  29.51 
 
 
487 aa  57  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  29.53 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  37.35 
 
 
489 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  29.75 
 
 
513 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  37.84 
 
 
535 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  21.52 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>