61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3380 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  100 
 
 		 509 aa  1044    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  49.9 
 
 		 508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  26.14 
 
 		 601 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  31.45 
 
 		 594 aa  193  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  32.05 
 
 		 602 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  25.38 
 
 		 600 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  25.65 
 
 		 602 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  30.48 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  29.91 
 
 		 590 aa  183  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  23.78 
 
 		 598 aa  183  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  23.78 
 
 		 598 aa  183  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  23.78 
 
 		 598 aa  183  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  24.1 
 
 		 582 aa  179  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  29.31 
 
 		 582 aa  177  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  30.11 
 
 		 586 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  30.11 
 
 		 586 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  30.11 
 
 		 586 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  31.29 
 
 		 596 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  29.83 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  30.32 
 
 		 595 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  29.83 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  29.83 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  29.83 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  29.83 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  30.12 
 
 		 594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  29.83 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  29.83 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  29.83 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  29.83 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  29.83 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  29.83 
 
 		 586 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  37.45 
 
 		 586 aa  173  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  23.83 
 
 		 593 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  30.92 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  31.58 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  30.12 
 
 		 592 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  29.55 
 
 		 586 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  31.29 
 
 		 596 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  31.29 
 
 		 596 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  27.1 
 
 		 604 aa  170  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  24.68 
 
 		 580 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  30.12 
 
 		 595 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  31.29 
 
 		 595 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  29.82 
 
 		 595 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  29.82 
 
 		 595 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  30.52 
 
 		 595 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  32.59 
 
 		 594 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  25.21 
 
 		 595 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  28.73 
 
 		 613 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  26.59 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  26.59 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  27.38 
 
 		 609 aa  90.5  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  25.28 
 
 		 615 aa  84.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  26.69 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  22.64 
 
 		 622 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  24.91 
 
 		 607 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  24.83 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  23.6 
 
 		 607 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  20.17 
 
 		 638 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  19.89 
 
 		 647 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  22.22 
 
 		 600 aa  52  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>