271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_52300 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  100 
 
 
642 aa  1291    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  88.28 
 
 
641 aa  1091    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  42.14 
 
 
624 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  41.24 
 
 
614 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  30.68 
 
 
622 aa  230  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  30.52 
 
 
613 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  28.1 
 
 
600 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  28.63 
 
 
607 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  27.64 
 
 
617 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  27.64 
 
 
617 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  28.66 
 
 
609 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  32.9 
 
 
625 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  26.05 
 
 
607 aa  201  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  35.94 
 
 
638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  35.62 
 
 
635 aa  196  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  29.9 
 
 
611 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  28.26 
 
 
647 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  28.08 
 
 
638 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  28.14 
 
 
600 aa  181  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  26.56 
 
 
637 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  28.31 
 
 
598 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  28.31 
 
 
598 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  28.31 
 
 
598 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  25.73 
 
 
595 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  25.4 
 
 
637 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  27.51 
 
 
602 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  31.74 
 
 
621 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  28.63 
 
 
602 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  28.35 
 
 
615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  27.56 
 
 
593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  30.97 
 
 
621 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  30.97 
 
 
621 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  25.75 
 
 
586 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  26.4 
 
 
586 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  26.22 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  29.07 
 
 
630 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  26.4 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  26.22 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  26.22 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  24.77 
 
 
580 aa  140  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  26.6 
 
 
590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  26.67 
 
 
590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  26.04 
 
 
601 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  26.26 
 
 
586 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  26.26 
 
 
586 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  25.58 
 
 
582 aa  137  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  26.26 
 
 
586 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  26.26 
 
 
586 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  26.26 
 
 
586 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  26.26 
 
 
586 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  26.26 
 
 
586 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  26.26 
 
 
586 aa  137  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  27.16 
 
 
594 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  25.16 
 
 
582 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  26.26 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  25.81 
 
 
595 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  25.08 
 
 
592 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  25.62 
 
 
595 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  25.62 
 
 
595 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  25.62 
 
 
595 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  24.63 
 
 
596 aa  120  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  25.71 
 
 
604 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  24.71 
 
 
595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  24.86 
 
 
594 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  24.36 
 
 
596 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  24.59 
 
 
596 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  24.4 
 
 
596 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  24.72 
 
 
595 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  23.15 
 
 
596 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  25.73 
 
 
594 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  30 
 
 
873 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  36.08 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  36.08 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  25.08 
 
 
630 aa  64.3  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1597  sulfatase  34.62 
 
 
522 aa  63.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00665248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  22.32 
 
 
639 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  26.18 
 
 
503 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  22.21 
 
 
639 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3501  sulfatase  31.36 
 
 
598 aa  58.9  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  22.48 
 
 
639 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  21.08 
 
 
639 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  36.63 
 
 
1041 aa  57.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4030  sulfatase  35.29 
 
 
765 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868128  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  25.25 
 
 
496 aa  57.4  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  20.91 
 
 
639 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  21.32 
 
 
639 aa  57  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  24.6 
 
 
654 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  24.6 
 
 
654 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  20.91 
 
 
639 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  21.28 
 
 
784 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  30.3 
 
 
516 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1626  sulfatase  33.01 
 
 
476 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.773199  normal  0.470838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  24.6 
 
 
654 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  30.3 
 
 
516 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  24.6 
 
 
654 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  30.3 
 
 
516 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  21.9 
 
 
650 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  24.6 
 
 
654 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  21.9 
 
 
639 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  26.79 
 
 
1065 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>