89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1903 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  60.27 
 
 
586 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  61.46 
 
 
586 aa  758    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  64.88 
 
 
598 aa  781    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  58.81 
 
 
586 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  58.81 
 
 
586 aa  722    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  67.28 
 
 
593 aa  817    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  64.88 
 
 
598 aa  781    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  64.88 
 
 
598 aa  781    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  58.81 
 
 
586 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  58.81 
 
 
586 aa  721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  58.81 
 
 
586 aa  720    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  58.81 
 
 
586 aa  721    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  60.27 
 
 
586 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  60.44 
 
 
586 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  60.44 
 
 
586 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  60.27 
 
 
586 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  58.81 
 
 
586 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  68.98 
 
 
590 aa  833    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  58.81 
 
 
586 aa  721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  69.09 
 
 
590 aa  847    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  95.02 
 
 
582 aa  1147    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  100 
 
 
582 aa  1196    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  58.81 
 
 
586 aa  721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  39.5 
 
 
602 aa  475  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  38.53 
 
 
601 aa  474  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  39.74 
 
 
602 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  39.43 
 
 
600 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  39.46 
 
 
580 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  34.12 
 
 
595 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  30.2 
 
 
596 aa  281  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  30.53 
 
 
592 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  30.18 
 
 
604 aa  276  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  29.7 
 
 
596 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  29.7 
 
 
596 aa  276  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  29.7 
 
 
596 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  29.21 
 
 
595 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  29.37 
 
 
595 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  29.26 
 
 
595 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  29.09 
 
 
595 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  28.38 
 
 
594 aa  257  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  29.3 
 
 
595 aa  257  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  29 
 
 
594 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  29.95 
 
 
595 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  27.6 
 
 
596 aa  253  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  26.9 
 
 
613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  29.85 
 
 
594 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  25.2 
 
 
617 aa  212  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  25.2 
 
 
617 aa  212  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  25 
 
 
609 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  25.67 
 
 
637 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  25.51 
 
 
637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  24.1 
 
 
622 aa  193  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  25.82 
 
 
586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  25.39 
 
 
607 aa  170  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  23.66 
 
 
607 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  26.98 
 
 
611 aa  161  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  25.67 
 
 
615 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  23.02 
 
 
647 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  23.02 
 
 
638 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  28.45 
 
 
509 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  26.68 
 
 
508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  26.93 
 
 
624 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  25.25 
 
 
625 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  23.79 
 
 
600 aa  140  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  22.74 
 
 
635 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  22.74 
 
 
638 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  26.2 
 
 
642 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  25.32 
 
 
641 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  25.21 
 
 
614 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  20.91 
 
 
621 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  20.89 
 
 
621 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  22.11 
 
 
621 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  23.34 
 
 
481 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  23.15 
 
 
630 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  25.69 
 
 
612 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  25.82 
 
 
500 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  29.73 
 
 
628 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  29.73 
 
 
628 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  28.83 
 
 
628 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  21.41 
 
 
628 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  21.68 
 
 
628 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  27.27 
 
 
519 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  30.84 
 
 
628 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  30.84 
 
 
628 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  30.84 
 
 
628 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  28.83 
 
 
628 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  28.83 
 
 
628 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  29.29 
 
 
519 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  21.98 
 
 
491 aa  43.9  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>