276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0308 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0308  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1872  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0196085  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0318  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000203347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0264  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000581931  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0041  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0331  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.222457  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0031  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.271657  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0072  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0211705  normal  0.918041 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt09  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184169  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0053  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  88 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  87.1 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0062  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000596481  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0075  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.300561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0022  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.928948 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2154  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.480765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>