More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0004 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0004  methyltransferase, HemK family  100 
 
 
290 aa  579  1e-164  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  35.16 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  31.31 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  27.74 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl633  polypeptide chain release factor methylase  36.56 
 
 
300 aa  110  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  29.05 
 
 
330 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  30.37 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  30.37 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  29.91 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.37 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.37 
 
 
283 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.37 
 
 
283 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  30.37 
 
 
283 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  29.91 
 
 
283 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.37 
 
 
283 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  28.5 
 
 
288 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0145  HemK family modification methylase  36.22 
 
 
270 aa  102  9e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.541699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  35.21 
 
 
279 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  30.34 
 
 
262 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  27.49 
 
 
279 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  29.81 
 
 
288 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  30.73 
 
 
280 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2191  HemK family modification methylase  31 
 
 
278 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.961515  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  29.39 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2153  HemK family modification methylase  31 
 
 
278 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  29.8 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.3 
 
 
289 aa  95.5  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.94 
 
 
299 aa  95.5  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  31.25 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.49 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  28.27 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0569  modification methylase, HemK family  31.36 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  28.27 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  27.48 
 
 
306 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  32.29 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  34.21 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0895  HemK family modification methylase  32.68 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00424484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  28.51 
 
 
278 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.27 
 
 
280 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  28.27 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  32.04 
 
 
359 aa  91.7  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  30.58 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1421  HemK family modification methylase  29.96 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0749193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.27 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  28.27 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  28.33 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  30.84 
 
 
587 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  30.84 
 
 
587 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  27.76 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  30.28 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  26.91 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.63 
 
 
296 aa  89  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  28.9 
 
 
271 aa  89  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  24.32 
 
 
286 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.08 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  26.46 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  31.41 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  29.11 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.59 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  28.96 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  29.92 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.96 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.11 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0447  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.93 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0432  HemK family modification methylase  30.77 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  31.73 
 
 
288 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.33 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  28.7 
 
 
283 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0293  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.72 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.96 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  25.6 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.03 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  26.24 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  30.88 
 
 
281 aa  86.7  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.36 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  34.52 
 
 
284 aa  85.9  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  26.24 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  26.17 
 
 
297 aa  85.5  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0303  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.91 
 
 
340 aa  85.9  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  25.2 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  30.09 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  26.29 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.07 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  27.49 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  24.26 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23730  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  28.79 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.24 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  27.05 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  30.52 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  27.27 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.91 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  25.52 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  27.81 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1569  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.28 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.72 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  27.44 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  27.78 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  27.27 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>