More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1829 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
453 aa  931    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
457 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
457 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 
458 aa  504  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
478 aa  498  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
472 aa  491  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
466 aa  485  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
466 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
466 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
486 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
484 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
481 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
468 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
466 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
485 aa  438  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
469 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
478 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
461 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
480 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
466 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
474 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
461 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
461 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
480 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
460 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
461 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
476 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
479 aa  428  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
459 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
487 aa  423  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
459 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
459 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
466 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
494 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
461 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
459 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
459 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
461 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 
459 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
455 aa  419  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
500 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
459 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
459 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
461 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
461 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
460 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  48.71 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
461 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
459 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
459 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
470 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
465 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
465 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
465 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
465 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
465 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
459 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
465 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
477 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
465 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
461 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
461 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
465 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
461 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
487 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
481 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
465 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
461 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
459 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
461 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
465 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
459 aa  411  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
461 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
460 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
493 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
490 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
465 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
465 aa  403  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>