More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0214 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  58.83 
 
 
520 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  61.34 
 
 
519 aa  638    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  59.38 
 
 
517 aa  637    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  61.46 
 
 
527 aa  646    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  65.89 
 
 
516 aa  710    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  61.25 
 
 
530 aa  644    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  100 
 
 
515 aa  1048    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  68.24 
 
 
508 aa  711    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  60.95 
 
 
520 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  62.43 
 
 
517 aa  666    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  61.34 
 
 
519 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  67.7 
 
 
516 aa  679    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  62.3 
 
 
516 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  61.42 
 
 
517 aa  672    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  65.89 
 
 
518 aa  711    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  65.76 
 
 
519 aa  698    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  98.45 
 
 
515 aa  1037    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  63.81 
 
 
514 aa  696    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  67.45 
 
 
522 aa  699    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  63.16 
 
 
516 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  59.65 
 
 
532 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  61.43 
 
 
528 aa  664    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  58.53 
 
 
531 aa  640    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  60.35 
 
 
527 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  61.14 
 
 
519 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  76.41 
 
 
512 aa  815    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  62.14 
 
 
550 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  60.58 
 
 
522 aa  638    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  69.71 
 
 
518 aa  725    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  59.38 
 
 
517 aa  648    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  77.01 
 
 
512 aa  816    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  58.64 
 
 
514 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  59.65 
 
 
522 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  60.74 
 
 
527 aa  634    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  64.15 
 
 
516 aa  695    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  58.72 
 
 
516 aa  639    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  64.92 
 
 
516 aa  701    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  63.18 
 
 
516 aa  658    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  67.32 
 
 
514 aa  702    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  58.01 
 
 
531 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  56.78 
 
 
516 aa  632  1e-180  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  60.04 
 
 
529 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  58.59 
 
 
551 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  60.69 
 
 
513 aa  633  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  59.52 
 
 
513 aa  629  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  60.32 
 
 
521 aa  631  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  59.26 
 
 
524 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  59.46 
 
 
546 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  56.98 
 
 
516 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  59.84 
 
 
534 aa  626  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  56.98 
 
 
516 aa  626  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  56.59 
 
 
516 aa  623  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  59.16 
 
 
514 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  58.8 
 
 
537 aa  622  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  59.81 
 
 
513 aa  622  1e-177  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  58.89 
 
 
540 aa  623  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  59.14 
 
 
510 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  58.85 
 
 
510 aa  622  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1342  carboxyl transferase  57.67 
 
 
511 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525317  normal  0.223983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  58.67 
 
 
536 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  59.61 
 
 
513 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  58.63 
 
 
519 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  58.75 
 
 
510 aa  621  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  58.91 
 
 
510 aa  620  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  60.08 
 
 
510 aa  618  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  57.73 
 
 
524 aa  616  1e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  59.28 
 
 
518 aa  616  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  57.63 
 
 
543 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  55.62 
 
 
531 aa  614  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  58.37 
 
 
510 aa  612  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  57.67 
 
 
514 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  57.48 
 
 
514 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  58.37 
 
 
520 aa  612  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  58.16 
 
 
510 aa  612  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  58.67 
 
 
518 aa  613  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  59.34 
 
 
510 aa  611  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  58.28 
 
 
530 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  57.73 
 
 
522 aa  614  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  57.55 
 
 
523 aa  610  1e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  58.06 
 
 
511 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  57.78 
 
 
510 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  58.72 
 
 
510 aa  609  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  58.72 
 
 
510 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  57.95 
 
 
516 aa  610  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  57.25 
 
 
541 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  57.78 
 
 
510 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  56.45 
 
 
514 aa  605  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  58.06 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  55.66 
 
 
515 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  56.81 
 
 
514 aa  607  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  58.25 
 
 
516 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  58.25 
 
 
516 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  57.75 
 
 
510 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  58.67 
 
 
531 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  57.86 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  57.95 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  58.28 
 
 
513 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  57.67 
 
 
510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  56.92 
 
 
510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  57.39 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>