More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1006 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
377 aa  765    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2674  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
371 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000116662  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
359 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 
359 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
358 aa  202  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
382 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
387 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.11 
 
 
388 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
387 aa  193  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
381 aa  192  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1024  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00115837  unclonable  0.00000000647947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
386 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
382 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
389 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.35 
 
 
400 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1552  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
398 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
383 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 
395 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
387 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.01 
 
 
400 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
400 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.01 
 
 
400 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
385 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 
392 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
383 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 
387 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.44 
 
 
872 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  32.89 
 
 
390 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 
382 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  32 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.91 
 
 
400 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.67 
 
 
400 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.91 
 
 
400 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
384 aa  178  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
387 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.09 
 
 
386 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  31.55 
 
 
381 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  32.89 
 
 
390 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  31.93 
 
 
389 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  34.75 
 
 
382 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
382 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  33.88 
 
 
382 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.44 
 
 
382 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0588  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  33.61 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  32.62 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  32.21 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  33.33 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.33 
 
 
384 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
382 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 
382 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
400 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  35.59 
 
 
382 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  35.59 
 
 
382 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.65 
 
 
386 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  35.59 
 
 
382 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
382 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 
399 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.33 
 
 
376 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
382 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  35.59 
 
 
382 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 
393 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
384 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  35.59 
 
 
382 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
386 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
387 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1083  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
381 aa  170  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.458923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
384 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
382 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
382 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
382 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
387 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
383 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
377 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  33.71 
 
 
387 aa  169  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
393 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0167  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 
369 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.1 
 
 
637 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
402 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
382 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
386 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
382 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1465  NADPH-dependent butanol dehydrogenase  30.77 
 
 
388 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
387 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
377 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>