More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4166 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  296  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  73.83 
 
 		 150 aa  223  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  71.33 
 
 		 151 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  68 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  66 
 
 		 152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  66 
 
 		 152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  66 
 
 		 152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  67.55 
 
 		 152 aa  194  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  62.67 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  59.18 
 
 		 148 aa  174  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  57.82 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 151 aa  166  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  54.67 
 
 		 152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  58.11 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  53.69 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  53.02 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  52.03 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  54.42 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  50.33 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  53.06 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  53.74 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  53.06 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  53.74 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  52.05 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  50 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  52.38 
 
 		 148 aa  133  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  50.34 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  47.3 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  46.98 
 
 		 148 aa  123  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 147 aa  116  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  46.67 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  47.97 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  48.99 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  42.28 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  40.94 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  39.19 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 171 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  42.28 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0756  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3348  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3583  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 152 aa  94.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 160 aa  94  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>