22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1085 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  100 
 
 		 741 aa  1489    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1161  hypothetical protein  24.7 
 
 		 800 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  22.48 
 
 		 955 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  33.13 
 
 		 881 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  19.58 
 
 		 796 aa  63.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  26.16 
 
 		 892 aa  58.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  28.57 
 
 		 877 aa  57.4  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  23.91 
 
 		 875 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  28.44 
 
 		 881 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  20.22 
 
 		 890 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  29.76 
 
 		 818 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  29.76 
 
 		 767 aa  51.6  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  29.76 
 
 		 767 aa  51.2  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  31 
 
 		 864 aa  49.3  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  27.93 
 
 		 808 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  20.88 
 
 		 702 aa  48.5  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  33.82 
 
 		 874 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  34.29 
 
 		 770 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0956  Protein of unknown function DUF2326  24.79 
 
 		 596 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.178488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  26.63 
 
 		 1051 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2913  hypothetical protein  27.5 
 
 		 517 aa  45.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  25.31 
 
 		 878 aa  44.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>